Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HMX3A6NHT5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMX3A6NHT5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMX3A6NHT5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HMX3A6NHT5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms