Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGMA1A4Y4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRGMA1A4Y4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGMA1A4Y4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms