Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms