Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J203 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0B4J203 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0B4J203 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0B4J203 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0B4J203 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J203 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J203 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J203 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J203 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J203 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J203 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J203 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J203 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A0A0B4J203 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J203 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J203 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J203 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J203 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A0B4J203 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0B4J203 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0B4J203 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0B4J203 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0B4J203 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0B4J203 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0B4J203 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A0B4J203 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J203 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J203 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A0B4J203 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J203 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J203 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J203 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J203 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J203 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J203 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0B4J203 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J203 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J203 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J203 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J203 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J203 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0B4J203 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0B4J203 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0B4J203 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0B4J203 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0B4J203 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0B4J203 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0B4J203 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0B4J203 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms