Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCSO14618 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCSO14618 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCSO14618 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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