RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.12■■■□□ 2.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.2■■■□□ 2.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.62■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.12■■□□□ 1.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.24■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APLP2Q06481 763 aa25.96■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM41Q8WV44 630 aa25.77■■□□□ 1.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCC9O60706 1549 aa25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.16■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HRCP23327 699 aa24.85■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.552e-7■■■■■ 27.6
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGAEP38570 1179 aa24.69■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCRIBQ14160 1630 aa24.53■■□□□ 1.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.51■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEFLP07196 543 aa24.45■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYT1Q01538 1121 aa24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.24■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.19■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.18■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NACADO15069 1562 aa24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.02■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEUROD1Q13562 356 aa23.82■■□□□ 1.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM52Q96A61 297 aa23.7■■□□□ 1.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.64■■□□□ 1.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 P3H3Q8IVL6 736 aa23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCANQ96GW7 911 aa23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.55■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARID3CA6NKF2 412 aa23.52■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBLN2P98095 1184 aa23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANP32CO43423 234 aa23.36■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.28■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EEA1Q15075 1411 aa23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.02■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA3Q08378 1498 aa23■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WIZO95785 1651 aa22.99■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMARCA2P51531 1590 aa22.99■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLIP1P30622 1438 aa22.97■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.94■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCL11AQ9H165 835 aa22.93■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP162Q5TB80 1403 aa22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF27Q86VH2 1401 aa22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TONSLQ96HA7 1378 aa22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FKBP8Q14318 412 aa22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.87■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.86■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMARCA4P51532 1647 aa22.85■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIER1Q8N108 512 aa22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.81■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOGA1O94964 1423 aa22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCC8Q09428 1581 aa22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC24A1O60721 1099 aa22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.225e-7■■□□□ 14
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.63■■□□□ 1.21
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