RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269143.7

AFG3L2-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AFG3L2, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-201ENST00000269143 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.03■■■□□ 2.72
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AFG3L2-201ENST00000269143 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.87■■■□□ 2.05
AFG3L2-201ENST00000269143 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
AFG3L2-201ENST00000269143 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
AFG3L2-201ENST00000269143 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.5■■□□□ 1.99
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.34■■□□□ 1.97
AFG3L2-201ENST00000269143 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
AFG3L2-201ENST00000269143 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.06■■□□□ 1.92
AFG3L2-201ENST00000269143 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27■■□□□ 1.91
AFG3L2-201ENST00000269143 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
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AFG3L2-201ENST00000269143 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.51■■□□□ 1.83
AFG3L2-201ENST00000269143 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.38■■□□□ 1.81
AFG3L2-201ENST00000269143 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
AFG3L2-201ENST00000269143 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
AFG3L2-201ENST00000269143 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.05■■□□□ 1.76
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AFG3L2-201ENST00000269143 MYT1Q01538 1121 aa25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2-201ENST00000269143 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2-201ENST00000269143 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
AFG3L2-201ENST00000269143 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.73■■□□□ 1.71
AFG3L2-201ENST00000269143 ABCC9O60706 1549 aa25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2-201ENST00000269143 SCRIBQ14160 1630 aa25.47■■□□□ 1.67
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AFG3L2-201ENST00000269143 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
AFG3L2-201ENST00000269143 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
AFG3L2-201ENST00000269143 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
AFG3L2-201ENST00000269143 TRIM41Q8WV44 630 aa25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2-201ENST00000269143 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2-201ENST00000269143 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
AFG3L2-201ENST00000269143 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
AFG3L2-201ENST00000269143 NACADO15069 1562 aa25.2■■□□□ 1.62
AFG3L2-201ENST00000269143 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.07■■□□□ 1.6
AFG3L2-201ENST00000269143 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2-201ENST00000269143 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.89■■□□□ 1.57
AFG3L2-201ENST00000269143 WIZO95785 1651 aa24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2-201ENST00000269143 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2-201ENST00000269143 MIER1Q8N108 512 aa24.73■■□□□ 1.55
AFG3L2-201ENST00000269143 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
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AFG3L2-201ENST00000269143 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.58■■□□□ 1.52
AFG3L2-201ENST00000269143 BCL11AQ9H165 835 aa24.46■■□□□ 1.51
AFG3L2-201ENST00000269143 SMARCA4P51532 1647 aa24.42■■□□□ 1.5
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AFG3L2-201ENST00000269143 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
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AFG3L2-201ENST00000269143 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
AFG3L2-201ENST00000269143 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2-201ENST00000269143 SMARCA2P51531 1590 aa24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2-201ENST00000269143 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2-201ENST00000269143 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.24■■□□□ 1.47
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AFG3L2-201ENST00000269143 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.21■■□□□ 1.47
AFG3L2-201ENST00000269143 ABCC8Q09428 1581 aa24.15■■□□□ 1.46
AFG3L2-201ENST00000269143 CEP162Q5TB80 1403 aa24.11■■□□□ 1.45
AFG3L2-201ENST00000269143 BCANQ96GW7 911 aa24.1■■□□□ 1.45
AFG3L2-201ENST00000269143 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
AFG3L2-201ENST00000269143 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.05■■□□□ 1.44
AFG3L2-201ENST00000269143 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.97■■□□□ 1.43
AFG3L2-201ENST00000269143 SOGA1O94964 1423 aa23.89■■□□□ 1.42
AFG3L2-201ENST00000269143 KCNH8Q96L42 1107 aa23.84■■□□□ 1.41
AFG3L2-201ENST00000269143 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.83■■□□□ 1.4
AFG3L2-201ENST00000269143 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.81■■□□□ 1.4
AFG3L2-201ENST00000269143 FKBP8Q14318 412 aa23.8■■□□□ 1.4
AFG3L2-201ENST00000269143 EEA1Q15075 1411 aa23.76■■□□□ 1.39
AFG3L2-201ENST00000269143 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.74■■□□□ 1.39
AFG3L2-201ENST00000269143 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
AFG3L2-201ENST00000269143 SYNJ1O43426 1573 aa23.71■■□□□ 1.39
AFG3L2-201ENST00000269143 ITGAEP38570 1179 aa23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2-201ENST00000269143 APLP2Q06481 763 aa23.7■■□□□ 1.38
AFG3L2-201ENST00000269143 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AFG3L2-201ENST00000269143 GOLGA3Q08378 1498 aa23.58■■□□□ 1.37
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AFG3L2-201ENST00000269143 MSH5O43196 834 aa23.52■■□□□ 1.36
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AFG3L2-201ENST00000269143 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.46■■□□□ 1.35
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AFG3L2-201ENST00000269143 TOP2BQ02880 1626 aa23.43■■□□□ 1.34
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AFG3L2-201ENST00000269143 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.34■■□□□ 1.33
AFG3L2-201ENST00000269143 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.33■■□□□ 1.32
AFG3L2-201ENST00000269143 NCAPD3P42695 1498 aa23.31■■□□□ 1.32
AFG3L2-201ENST00000269143 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
AFG3L2-201ENST00000269143 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
AFG3L2-201ENST00000269143 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
AFG3L2-201ENST00000269143 CUX1P39880 1505 aa23.18■■□□□ 1.3
AFG3L2-201ENST00000269143 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
AFG3L2-201ENST00000269143 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
AFG3L2-201ENST00000269143 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.16■■□□□ 1.3
AFG3L2-201ENST00000269143 PRXQ9BXM0 1461 aa23.16■■□□□ 1.3
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