RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219551.2

RHBDL1-201, Transcript of rhomboid like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDL1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1-201ENST00000219551 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.93■■■■■ 4.78
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RHBDL1-201ENST00000219551 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
RHBDL1-201ENST00000219551 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.28■■■■□ 3.56
RHBDL1-201ENST00000219551 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.22■■■■□ 3.55
RHBDL1-201ENST00000219551 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.1■■■■□ 3.53
RHBDL1-201ENST00000219551 NACADO15069 1562 aa37.06■■■■□ 3.52
RHBDL1-201ENST00000219551 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.92■■■■□ 3.5
RHBDL1-201ENST00000219551 SCRIBQ14160 1630 aa36.19■■■■□ 3.38
RHBDL1-201ENST00000219551 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.1■■■■□ 3.37
RHBDL1-201ENST00000219551 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.95■■■■□ 3.35
RHBDL1-201ENST00000219551 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.77■■■■□ 3.32
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RHBDL1-201ENST00000219551 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.92■■■■□ 3.18
RHBDL1-201ENST00000219551 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
RHBDL1-201ENST00000219551 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
RHBDL1-201ENST00000219551 SMARCA4P51532 1647 aa34.69■■■■□ 3.14
RHBDL1-201ENST00000219551 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.64■■■■□ 3.14
RHBDL1-201ENST00000219551 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
RHBDL1-201ENST00000219551 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.44■■■■□ 3.1
RHBDL1-201ENST00000219551 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.35■■■■□ 3.09
RHBDL1-201ENST00000219551 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.32■■■■□ 3.09
RHBDL1-201ENST00000219551 SMARCA2P51531 1590 aa34.32■■■■□ 3.08
RHBDL1-201ENST00000219551 WIZO95785 1651 aa34.31■■■■□ 3.08
RHBDL1-201ENST00000219551 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
RHBDL1-201ENST00000219551 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.24■■■■□ 3.07
RHBDL1-201ENST00000219551 NCAPD3P42695 1498 aa34.2■■■■□ 3.07
RHBDL1-201ENST00000219551 HMGXB3Q12766 1538 aa34.08■■■■□ 3.05
RHBDL1-201ENST00000219551 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
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RHBDL1-201ENST00000219551 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.6■■■□□ 2.97
RHBDL1-201ENST00000219551 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.25■■■□□ 2.91
RHBDL1-201ENST00000219551 CFTRP13569 1480 aa33.2■■■□□ 2.91
RHBDL1-201ENST00000219551 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.17■■■□□ 2.9
RHBDL1-201ENST00000219551 NESP48681 1621 aa33.14■■■□□ 2.9
RHBDL1-201ENST00000219551 PRDM2Q13029 1718 aa33.01■■■□□ 2.87
RHBDL1-201ENST00000219551 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.93■■■□□ 2.86
RHBDL1-201ENST00000219551 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.85■■■□□ 2.85
RHBDL1-201ENST00000219551 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.76■■■□□ 2.84
RHBDL1-201ENST00000219551 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.73■■■□□ 2.83
RHBDL1-201ENST00000219551 ERCC6Q03468 1493 aa32.72■■■□□ 2.83
RHBDL1-201ENST00000219551 ABCC8Q09428 1581 aa32.58■■■□□ 2.81
RHBDL1-201ENST00000219551 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.54■■■□□ 2.8
RHBDL1-201ENST00000219551 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.52■■■□□ 2.8
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RHBDL1-201ENST00000219551 CUX1P39880 1505 aa32.45■■■□□ 2.78
RHBDL1-201ENST00000219551 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.44■■■□□ 2.78
RHBDL1-201ENST00000219551 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.41■■■□□ 2.78
RHBDL1-201ENST00000219551 TOPBP1Q92547 1522 aa32.41■■■□□ 2.78
RHBDL1-201ENST00000219551 SYNJ1O43426 1573 aa32.39■■■□□ 2.78
RHBDL1-201ENST00000219551 WDR62O43379 1518 aa32.39■■■□□ 2.78
RHBDL1-201ENST00000219551 TOP2BQ02880 1626 aa32.38■■■□□ 2.77
RHBDL1-201ENST00000219551 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.36■■■□□ 2.77
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RHBDL1-201ENST00000219551 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.22■■■□□ 2.75
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RHBDL1-201ENST00000219551 WDR97A6NE52 1622 aa31.9■■■□□ 2.7
RHBDL1-201ENST00000219551 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
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RHBDL1-201ENST00000219551 KIF27Q86VH2 1401 aa31.8■■■□□ 2.68
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RHBDL1-201ENST00000219551 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.74■■■□□ 2.67
RHBDL1-201ENST00000219551 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.74■■■□□ 2.67
RHBDL1-201ENST00000219551 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.72■■■□□ 2.67
RHBDL1-201ENST00000219551 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
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RHBDL1-201ENST00000219551 KIF21BO75037 1637 aa31.29■■■□□ 2.6
RHBDL1-201ENST00000219551 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
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RHBDL1-201ENST00000219551 GOLGA3Q08378 1498 aa31.18■■■□□ 2.58
RHBDL1-201ENST00000219551 CHD1O14646 1710 aa31.17■■■□□ 2.58
RHBDL1-201ENST00000219551 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.13■■■□□ 2.57
RHBDL1-201ENST00000219551 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.09■■■□□ 2.57
RHBDL1-201ENST00000219551 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
RHBDL1-201ENST00000219551 NUP160Q12769 1436 aa31.03■■■□□ 2.56
RHBDL1-201ENST00000219551 CEP170Q5SW79 1584 aa31■■■□□ 2.55
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