Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CTDP1Q9Y5B0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CTDP1Q9Y5B0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTDP1Q9Y5B0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTDP1Q9Y5B0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDP1Q9Y5B0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 562.4 ms