Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HES2Q9Y543 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HES2Q9Y543 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HES2Q9Y543 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HES2Q9Y543 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HES2Q9Y543 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HES2Q9Y543 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HES2Q9Y543 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms