Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
WASHC2CQ9Y4E1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
WASHC2CQ9Y4E1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
WASHC2CQ9Y4E1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
WASHC2CQ9Y4E1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms