Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF6Q9Y252 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF6Q9Y252 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF6Q9Y252 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF6Q9Y252 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF6Q9Y252 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms