Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDZRN3Q9UPQ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDZRN3Q9UPQ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDZRN3Q9UPQ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDZRN3Q9UPQ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms