Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBLCQ9ULV8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CBLCQ9ULV8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBLCQ9ULV8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLCQ9ULV8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms