Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB23Q9ULC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB23Q9ULC3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB23Q9ULC3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB23Q9ULC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms