Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HDAC9Q9UKV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HDAC9Q9UKV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
HDAC9Q9UKV0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
HDAC9Q9UKV0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms