Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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LAMP5Q9UJQ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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LAMP5Q9UJQ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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LAMP5Q9UJQ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMP5Q9UJQ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP5Q9UJQ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP5Q9UJQ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP5Q9UJQ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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LAMP5Q9UJQ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP5Q9UJQ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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LAMP5Q9UJQ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP5Q9UJQ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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LAMP5Q9UJQ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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LAMP5Q9UJQ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP5Q9UJQ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP5Q9UJQ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP5Q9UJQ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP5Q9UJQ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP5Q9UJQ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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