Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFC0

LRWD1, Leucine-rich repeat and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRWD1Q9UFC0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRWD1Q9UFC0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRWD1Q9UFC0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRWD1Q9UFC0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRWD1Q9UFC0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms