Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNRD1Q9P1U0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNRD1Q9P1U0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms