Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NECAP2Q9NVZ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NECAP2Q9NVZ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms