Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM140Q9NV12 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM140Q9NV12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM140Q9NV12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM140Q9NV12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms