Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CMC2Q9NRP2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMC2Q9NRP2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMC2Q9NRP2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CMC2Q9NRP2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms