Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL1Q9NR64 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL1Q9NR64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL1Q9NR64 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL1Q9NR64 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL1Q9NR64 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms