Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASS4Q9NQ75 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASS4Q9NQ75 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASS4Q9NQ75 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASS4Q9NQ75 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASS4Q9NQ75 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms