Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLMQ9NP87 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLMQ9NP87 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLMQ9NP87 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLMQ9NP87 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms