Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP86

CABP5, Calcium-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP5Q9NP86 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CABP5Q9NP86 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CABP5Q9NP86 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CABP5Q9NP86 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP5Q9NP86 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CABP5Q9NP86 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CABP5Q9NP86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms