Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ROPN1Q9HAT0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ROPN1Q9HAT0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROPN1Q9HAT0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1Q9HAT0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1Q9HAT0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1Q9HAT0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1Q9HAT0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1Q9HAT0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROPN1Q9HAT0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ROPN1Q9HAT0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROPN1Q9HAT0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms