Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms