Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80BQ9C086 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
INO80BQ9C086 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INO80BQ9C086 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80BQ9C086 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80BQ9C086 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80BQ9C086 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80BQ9C086 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
INO80BQ9C086 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INO80BQ9C086 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INO80BQ9C086 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INO80BQ9C086 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INO80BQ9C086 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INO80BQ9C086 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INO80BQ9C086 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80BQ9C086 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.52■■■□□ 2
INO80BQ9C086 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80BQ9C086 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80BQ9C086 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80BQ9C086 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80BQ9C086 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INO80BQ9C086 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INO80BQ9C086 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80BQ9C086 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80BQ9C086 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms