Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM6SF1Q9BZW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TM6SF1Q9BZW5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM6SF1Q9BZW5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM6SF1Q9BZW5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM6SF1Q9BZW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
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