Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC13A1Q9BZW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC13A1Q9BZW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC13A1Q9BZW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC13A1Q9BZW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms