Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
RNF17Q9BXT8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RNF17Q9BXT8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RNF17Q9BXT8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RNF17Q9BXT8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RNF17Q9BXT8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms