Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC94Q9BW85 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC94Q9BW85 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC94Q9BW85 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC94Q9BW85 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms