Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAAF1Q9BRP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAAF1Q9BRP4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PAAF1Q9BRP4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms