Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOPXQ9BPY8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOPXQ9BPY8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOPXQ9BPY8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOPXQ9BPY8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms