Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGREF1Q99674 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGREF1Q99674 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGREF1Q99674 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGREF1Q99674 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms