Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF6Q99612 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF6Q99612 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF6Q99612 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLF6Q99612 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms