Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN18Q96SJ8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN18Q96SJ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN18Q96SJ8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSPAN18Q96SJ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.8 ms