Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK4Q96L34 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARK4Q96L34 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARK4Q96L34 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARK4Q96L34 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARK4Q96L34 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARK4Q96L34 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARK4Q96L34 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARK4Q96L34 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARK4Q96L34 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARK4Q96L34 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARK4Q96L34 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARK4Q96L34 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARK4Q96L34 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms