Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABS1Q96KC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CABS1Q96KC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CABS1Q96KC9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CABS1Q96KC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms