Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSANTD3Q96H12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MSANTD3Q96H12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSANTD3Q96H12 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSANTD3Q96H12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms