Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMT2BQ96GJ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT2BQ96GJ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT2BQ96GJ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms