Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCMH1Q96GD3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCMH1Q96GD3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCMH1Q96GD3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCMH1Q96GD3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms