Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAMBPL1Q96FJ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAMBPL1Q96FJ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STAMBPL1Q96FJ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STAMBPL1Q96FJ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STAMBPL1Q96FJ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAMBPL1Q96FJ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.4 ms