Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGF29Q96ES7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SGF29Q96ES7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGF29Q96ES7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGF29Q96ES7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms