Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC126Q96EE4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC126Q96EE4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC126Q96EE4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms