Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO6Q96DC7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMCO6Q96DC7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO6Q96DC7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms