Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8orf44Q96CB5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf44Q96CB5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf44Q96CB5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf44Q96CB5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf44Q96CB5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms