Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERCC4Q92889 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC4Q92889 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC4Q92889 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC4Q92889 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERCC4Q92889 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERCC4Q92889 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ERCC4Q92889 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERCC4Q92889 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ERCC4Q92889 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC4Q92889 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms