Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DHX38Q92620 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX38Q92620 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX38Q92620 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms